Využívá se především jako dochucovací koření podporující chuť k jídlu a zajišťuje klidné trávení. Muškátový oříšek i květ mají své místo v pokrmech slaných i sladkých. Jeho chuť je nezaměnitelná, a tím i nenahraditelná. Koření z muškátového oříšku je nedílnou součástí perníků, dá se s nimi zdobit kapučÍno, v malých množstvích ozvláštní štrúdl a další moučníky. Neobejdou se bez něj krémové polévky, jako je květáková či dýňová, neměl by chybět ve špenátu, ale také v masitých jídlech a uzenářských výrobků.